当出现腹泻时若不及时治疗的话，危害是非常大的，引起小儿腹泻的原因是很复杂的，婴儿腹泻是婴儿时期常见的一种疾病，那么，到底是什么原因会引起腹泻呢?
1、肠道感染未彻底消除，可从迁延性及慢性腹泻孩子的粪便中培养出痢疾杆菌、沙门氏菌、大肠杆菌、耶尔森肠炎杆菌、空肠弯曲菌，有时可分离出轮状病毒。这些病原微生物在肠道中持续存在，表明肠道免疫功能低下，消除肠道感染的能力不足。
肠道致病微生物不能消除，肠粘膜损害持续存在，双糖酶，尤其是乳糖酶缺乏，因此食物中的双糖不能吸收，滞留肠腔形成高渗状态，肠壁液体移至肠腔，引起渗透性腹泻。
2、乳糜泻，大约乳糜泻患儿的80%～90%人类白细胞抗原阳性，表明人类白细胞抗原阳性的孩子容易发生乳糜泻。发病机理还不清楚，可能与孩子对麦类食物中的麦醇溶蛋白过敏有关。
主要病变在小肠，特点是脂肪吸收不良。多在2岁以下发病，食谷蛋白食物3～6个月开始频繁腹泻，大便量多稀薄，灰白色，有恶臭味，有泡沫及脂肪。停用谷类食物，数天至数周后，大便逐渐恢复正常，重复用谷蛋白食物则再次发病。
3、牛奶蛋白过敏，牛奶蛋白主要包括酪蛋白、α-乳白蛋白、β-乳球蛋白、牛血清蛋白和γ-球蛋白。约03%～7.5%的婴儿牛奶喂养发生过敏性腹泻。有报告认为β-乳球蛋白和乳白蛋白是主要过敏原。牛奶蛋白过敏引起消化道粘膜水肿、渗出、平滑肌痉挛及出血，多在生后 6个月内，尤其是3个月内出现口唇及口腔粘膜水肿、呕吐、腹痛及腹泻。
