感染Hp 后大多数患者表现隐匿，无细菌感染的全身症状，也常无胃炎的急性期症状，临床上患者往往以慢性胃炎、消化性溃疡等表现就诊。
从吞食活菌自愿者试验结果可见，感染先引起急性胃炎，未治疗或未彻底治疗，而发展为慢性胃炎。急性感染潜伏期2～7 天，胃镜下表现为胃窦急性充血糜烂，组织学检查黏膜层有充血、水肿及中性粒细胞浸润，症状可表现为腹痛、腹胀、晨起恶心、反酸、嗳气、饥饿感，重者出现呕吐。
现已有足够证据表明，Hp 是引起慢性胃炎的主要原因。慢性胃炎Hp 检出率54%～，慢性活动性胃炎Hp 检出率为90%以上。不仅引起胃窦炎，也可引起胃体底炎，临床表现无特征性，常见上腹部疼痛、不适、饱胀、嗳气等上消化道症状。胃和十二指肠溃疡(GU&DU)的发生、发展、愈合及复发过程中，Hp 起着十分重要的作用。在GU 中Hp 检出率多在80%以上，DU 中检出率多在90%以上。有82.5%的DU 患者十二指肠并发胃化生，胃化生和Hp 感染是发生DU 的先决条件。
目后认为根除Hp 是治愈和防止溃疡复发的关键。低度恶性胃MALT 淋巴瘤一般认为与Hp 阳性慢性胃炎相关，根除Hp 治疗可使77%～83%胃MALT 淋巴瘤消退。
因而，提倡对其作积极的Hp 根除治疗。长期Hp 感染者胃腺癌的发病率增高，并认为与Cag A 和Vac A 基因有关，产Cag A 蛋白和Vac A s1/ml 基因型的Hp 菌株诱发胃癌的发生率更高。Hp 感染还和Barrett 食管炎、胃食管反流、功能性消化不良等关系密切。
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