消化性溃疡多呈圆形或卵圆形。溃疡的边缘整齐，一般与周围枯膜相平或稍高，溃疡壁陡直，底部深，常穿透肌层达浆膜层。
发病时间较长的溃疡可呈斜漏斗形.溃疡的贵门侧较深且边缘陡峭，幽门侧较浅且边缘的粘膜下层、环肌层及肌层断端相继突起呈阶梯状，这是在溃疡形成过程中胃的蠕动所导致。
当胃壁自胃体向幽门方向运动时，演疡处各层移动程度不同，粘膜层移动很大，其次为环肌层，再次为纵肌层，以致形成斜向幽门的阶梯状边缘。溃疡的底面较清洁，可有少量渗出物及凝血块附着。
显微镜下观察，溃疡的基底部大致由4层组织构成。由浅入深层为炎性渗出物，主要由白细胞和纤维素构成;第二层为坏死组织，含嗜酸性坏死组织及破碎的细胞核;第三层为肉芽组织。
其中有丰富的与溃疡底面呈垂直方向排列的毛细血管;下层为瘫痕组织，由致密的胶原纤维构成。演疡时间越久，康痕形成越多，增生的纤维组织向周围的肌层下扩展，将肌层断端上推移，使肌层断端与其上的粘膜肌层断端吻合，底部纤维组织与浆膜融合，并可与邻近的肝、胰等器官的包膜形成粘连。
瘫痕组织内的小动脉常有增生性动脉内膜炎，管壁增厚、管腔狭窄，有时有血栓形成，从而引起局部缺血，影响组织再生.这也是形成演疡复发的病理基础之一。底部的神经节细胞常有变性和神经纤维断裂，可能是引起疼痛的重要原因。
溃疡边缘的表面上皮及腺体常有增生，有时出现不典型增生，周围粘膜常有慢性炎症和水肿，严重者枯膜面呈粗颗粒状，并可见到灶状分布的肠上皮化生。
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