小儿幽门螺杆菌感染常至患儿消瘦，营养缺乏并发贫血;可并发消化性溃疡，可致消化道出血，少数可至萎缩性胃炎和胃癌。常见的幽门螺杆菌感染引发的并发症为出血或穿孔。
1、出血：出血的并发症有时可以是溃疡的首发症状而无任何后驱表现。呕血一般见于胃溃疡，吐出物呈咖啡样，而黑便较多见于十二指肠溃疡。当出血量较多时任何一种溃疡可同时表现呕血与黑便，在小儿胃内引流物呈血性多提示胃出血但引流物阴性者，不能排除十二指肠溃疡合并出血的可能(因为血液可不经幽门反流入胃)。
2、穿孔：穿孔较出血少见得多，溃疡穿孔常突然发生，可无任何先兆症状。少数儿童可无溃疡病史以穿孔并发症为首发症状经手术证实为十二指肠溃疡伴穿孔。在新生儿早期也可见应激性胃溃疡穿孔表现腹痛、腹胀。
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