患者血清及腹水中C3及C4补体比正常人高，补体增高意味着炎症的存在。这种引起补体参与的炎症是针对异位的内膜，是一种自身免疫反应。抗卵巢抗体升高可影响排卵和黄体功能不全，抗子宫内膜抗体升高可影响子宫内膜的改变而不利于孕卵着床。
子宫内膜异位症是如何导致女性不孕的呢?
1.黄素化卵泡不破裂综合征(LUF)。即指卵泡黄素化而无排卵、卵泡成熟并黄素化而形成黄体，但成熟的卵子并不破出黄体而进入腹腔。虽然血清内孕激素浓度增加、基础体温双相，子宫内膜呈分泌期改变，但腹腔镜下在卵巢黄体上见不到排卵后的破孔。腹水内孕激素含量也显着低于正常。据报道子宫内膜异位症中，LUF的发生率可高达75%，且提出检测腹水内孕激素的含量是诊断本征的方法。
2.子宫内膜异位可伴随不排卵。据报道子宫内膜异位症有17%-27%不排卵，其机制和患者卵泡细胞的LH受体少有关。
3.卵巢黄体期缺陷。观察到部分患者黄体期≤10天，子宫内膜定期病理检查黄体期缺陷，其黄体缺陷的发生率据报道为25%-40%。黄体功能不全不但降低受孕率，同时增加自然流产率。
4.腹水的量、成分与不孕。患者的腹水量为10-20ml。
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